Zu den Nachteilen der Photovoltaik- Technik gehören die relativ hohen Anschaffungskosten einer solchen Anlage. Auch wenn die laufenden Kosten dann zum größten Teil wegfallen, muss man Kosten in Höhe von bis zu 4000 Euro für die Anschaffung einplanen.
Zudem ist die Herstellung der einzelnen Solarzellen nicht besonders umweltfreundlich. Sie werden größtenteils aus chemischen Materialien hergestellt, wie zum Beispiel Silizium.
Deshalb ist auch die Entsorgung von Solaranlagen kritisch zu betrachten.
Mit einer Photovoltaik- Anlage ist man außerdem sehr wetterabhängig. Da gerade in Deutschland oft sehr unbeständiges Wetter herrscht, im Gegensatz zu sonnenverwöhnten Ländern wie Spanien oder Italien, ist Solarenergie hierzulande nicht gerade die zuverlässigste Energiequelle.
Ein weiterer Nachteil ist, dass die Effizient der Solaranlagen noch nicht vollständig ausgereift ist. Immer noch geht, aufgrund der suboptimalen Speicherung, viel Energie verloren.
Der Anteil von Solarenergie am deutschen Strommarkt betrug 2006 gerade mal 0,5 Prozent.